- Kauno.diena.lt inf.
- Teksto dydis:
- Spausdinti
Prestižinio žurnalo „Molecular Cell“ vasario numeryje pristatomas Vilniaus universiteto Gyvybės mokslų centro Biotechnologijos instituto mokslininkų grupės (Zdislav Staševskij, Povilas Gibas, dr. Juozas Gordevičius, dr. Edita Kriukienė ir prof. Saulius Klimašauskas) sukurtas naujas DNR modifikavimo profilių analizės metodas TOP-seq (angl. Tethered Oligonucleotide-Primed sequencing).
Publikacijoje VU mokslininkai pirmą kartą pritaikė netipišką kovalentinį nemodifikuotų CG sekų žymėjimą žmogaus genomo modifikacijų analizei. Žymėjimo reakcijos metu prie kiekvieno tiriamo CG dinukleotido yra chemiškai prijungiamas universalus DNR pradmuo, kurį DNR polimerazė panaudoja DNR sintezės invazijai į genominę DNR – tai naujas ir netipiškas DNR polimerazės gebėjimas, kurio mechanizmas dar neištirtas. Taip nuo žymėtų CG dinukleotidų yra inicijuojama DNR polimerizacija ir nuskaitomos kaimyninės sritys, leidžiančios nustatyti CG poziciją genominėje DNR nukleotido tikslumu.
„Molecular Cell“ publikuotame straipsnyje taip pat pristatomas žmogaus sveikų ir vėžinių audinių epigenetinių DNR modifikavimo profilių tyrimas, kuris parodė, kad TOP-seq metodas pasižymi aukšta skiriamąja geba, jautrumu, greita kompiuterine duomenų analize ir ekonomiškumu. VU mokslininkų grupės nuomone, naujasis metodas leis paspartinti ir atpiginti klinikinius epigenetinių ligų tyrimus, kuriuos dažnai riboja didelės įprastų epigenominių metodų sąnaudos, o tai palengvins novatoriškų medicinos diagnostikos priemonių kūrimą.
DNR metilinimas CG sekose yra kertinis aukštesniųjų organizmų, įskaitant žmogaus, epigenetinės reguliacijos veiksnys, charakterizuojantis skirtingus audinius bei ląstelių tipus ir lemiantis ląstelės genų raiškos ypatumus. DNR modifikavimo pokyčiai siejami su senėjimo procesais, taip pat daugelio kompleksinių ligų, pavyzdžiui, diabeto, šizofrenijos ar vėžio, atsiradimu ir tėkme. Šis naujas DNR modifikavimo profilių analizės metodas leidžia kryptingai kovalentiškai pažymėti nemodifikuotas genomo sritis ir tiksliai nustatyti nemodifikuotų CG pozicijas genominėje DNR.
VU mokslininkų grupės idėja DNR metilinimo profilių nustatymui panaudoti nemodifikuotų genominių sričių analizę jau pristatyta 2013 m. publikacijoje „Nature Communications“ žurnale, priklausančiam vienai autoritetingiausių pasaulio mokslo leidyklų „Nature Publishing Group“.
„Molecular Cell“ yra vienas priešakinių „Cell Press / Elsevier“ leidyklos mokslo žurnalų, kuriame spausdinami išskirtinio mokslinio lygio molekulinės biologijos srities straipsniai. Leidinio citavimo indeksas pagal Clarivate Analytics ISI Web of Science (IF – 14) 3 kartus viršija agreguotą kategorijos „Biochemistry & Molecular biology“ indeksą ir jis patenka tarp 2 proc. geriausių šios kategorijos žurnalų (4 vieta iš 289).
NAUJAUSI KOMENTARAI
SUSIJĘ STRAIPSNIAI
-
Vilniuje užsienio turistų pernai daugėjo 12 proc., šiemet laukiama 11 proc. augimo2
Pernai Vilniuje apsilankė penktadaliu daugiau turistų iš užsienio nei 2022 metais, o bendras sostinės svečių skaičius paaugo 12 proc., skelbia turizmo ir verslo plėtros agentūra „Go Vilnius“. ...
-
Vilniuje atsiras audiogidas dar vienam viešojo transporto maršrutui
Vilniuje atsiras audiogidas dar vienam viešojo transporto maršrutui – su išskirtinėmis vietomis ir jų istorija keleiviai susipažinti galės vykdami 6G autobusu nuo Šnipiškiu iki Naujosios Vilnios. ...
-
Vilnius ryžosi pokyčiams: kol pėstieji džiaugsis, vairuotojams prireiks kantrybės1
Vilnius prailgina žalios šviesos degimo laiką. Nuo šiol net 132 sankryžų signalai degs ilgiau. Sostinės susisiekimo piramidės pagrindas – pėstieji, todėl tobulinant išmaniąją eismo valdymo sistemą yra užtikrinamas sklande...
-
Lietuvoje vyksta pratybos simuliuojant avariją Astravo atominėje1
Nuo ryto Lietuvoje vyksta pratybos simuliuojant avariją Astravo atominėje, kuri yra vos už 50 kilometrų nuo Vilniaus. Tikrinama ir gyventojų perspėjimo sistema, taip pat bandoma, kaip vyktų gyventojų išvežimas iš grėsmingų zonų gele...
-
V. Dolinskas toliau vadovaus LDK Valdovų rūmų muziejui2
Kultūros ministerijos konkursą eiti Nacionalinio muziejaus Lietuvos Didžiosios Kunigaikštystės Valdovų rūmų generalinio direktoriaus pareigas laimėjo ligšiolinis muziejaus vadovas Vydas Dolinskas. ...
-
Vilniuje atidaryti grupinio gyvenimo namai3
Pirmadienį Vilniuje atidaryti nevyriausybinės organizacijos – Lietuvos sutrikusio intelekto žmonių globos bendrijos „Viltis“ – įsteigti grupinio gyvenimo namai, pranešė Socialinės apsaugos ir darbo ministerija (SADM). ...
-
Naktinis klubas kratosi kaltinimų: užsieniečius išvijo ne dėl rasės, o dėl smarvės?123
Lygių galimybių kontrolierius paskelbė, jog vienas naktinis klubas Vilniuje, išprašęs užsieniečius, diskriminavo juos dėl rasės. Išprašyti vyrai iš Kamerūno ir Nigerijos. Klubo savininkas šokiruotas, sako, kad...
-
Vilniaus senamiesčio gatvėse – eismo ribojimai
Sostinės senamiesčio gatvėse dėl remonto darbų nuo pirmadienio iki kovo 29 dienomis bus įvesti laikini eismo ribojimai, rašo portalas „Made in Vilnius“. ...
-
Sostinės kelininkai įspėja: pirmadienio rytą Vilniuje galimas plikledis
Hidrometeorologijos tarnybai pranešant apie galimą plikledį, Vilniaus miesto gatves prižiūrinti „Grinda“ pradėjo prevencinius kelio barstymus. ...
-
Rusijoje vykstant tariamiems prezidento rinkimams, Vilniuje – protestas prieš V. Putiną22
Vykstant vadinamiesiems Rusijos prezidento rinkimams, sekmadienį prie Rusijos ambasados sostinėje surengtas piketas „Vidudienis prieš Putiną“. ...